Un equipo de científicos del Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos (INTA) y del Centro de Investigación e Innovación en Acuicultura (CRIA) de la Universidad de Chile presentó el estudio más completo hasta la fecha sobre las proteínas quinasas del salmón del Atlántico (Salmo salar). La investigación, publicada en la revista Aquaculture, identifica y caracteriza 1.294 genes de quinasas, constituyendo el quinoma más grande reportado para cualquier especie animal.
Las proteínas quinasas (PK) constituyen una superfamilia de enzimas esenciales para prácticamente todos los procesos celulares. A pesar de su papel crítico, aún no se ha realizado un estudio exhaustivo de la familia de las proteínas quinasas en el salmón del Atlántico (Salmo salar).
“Aquí, presentamos una identificación y caracterización exhaustiva de las proteínas quinasas (PK) en Salmo salar, proporcionando así el quinoma más extenso reportado para cualquier especie animal hasta la fecha. Empleando una combinación de enfoques bioinformáticos, identificamos 1157 proteínas quinasas eucariotas (ePK) y 137 proteínas quinasas atípicas (aPK), con un total de 1294 genes de quinasas”, destacan los investigadores.
Las ePK se clasificaron en nueve grupos y 115 familias, siendo las tirosina quinasas (TK) y las quinasas dependientes de calcio/calmodulina (CAMK) las más abundantes. Además, se identificaron 96 pseudoquinasas, distribuidas en varios grupos. Además, clasificamos las 137 aPK en cuatro grupos y 17 familias, donde las supuestas proteínas quinasas estructuralmente atípicas (SAPPK) representan el grupo más grande.
“Además, realizamos un análisis transcripcional de la expresión génica de las quinasas en seis tejidos del salmón, revelando patrones de expresión específicos de cada tejido. En particular, se encontró que 99 quinasas eran más abundantes en el músculo, mientras que 53 quinasas exhibieron una menor abundancia y el análisis de enriquecimiento funcional demostró que las quinasas musculares están involucradas en procesos clave como la diferenciación muscular, la señalización del calcio y la regulación de la vía MAPK (proteínas quinasas activadas por mitógenos)”, detallan
Finalmente, un análisis comparativo de los quinomas del salmón del Atlántico y los humanos reveló un alto grado de conservación entre los grupos y familias de quinasas, al tiempo que identificó quinasas únicas en cada especie. “Estos resultados resaltan la conservación evolutiva de las proteínas quinasas en todas las especies y brindan información valiosa sobre el papel de las quinasas en Salmo salar, particularmente en el desarrollo y la función muscular”, comenta el equipo investigador.
Este extenso recurso sobre quinomas establece una base sólida para futuros estudios funcionales destinados a dilucidar el papel de las proteínas quinasas en la fisiología del salmón y sus posibles aplicaciones biotecnológicas.
Fotografía: Archivo referencial.
